Nasceu em Tartanedo, em uma família abastada. Perdeu o pai aos quatro anos de idade e viu-se herdeira de um considerável patrimônio. Em 1577, estando viva a reformadora Teresa de Jesus, entrou no mosteiro das carmelitas descalças de Toledo.
Viveu no mosteiro de Toledo pelo resto da vida, com exceção de um breve período em que participou da fundação de um Carmelo teresiano em Cuerva. A princípio, exerceu funções humildes, mas depois foi nomeada mestra das noviças e subpriora.
Foi eleita priora, mas, por causa de acusações feitas contra ela diante do visitador por uma Irmã – Catarina da Assunção – movida pela inveja, foi deposta em 1600. Em 1619, após dezenove anos de cruel e feroz perseguição, Irmã Catarina se reconciliou com Maria de Jesus e morreu serenamente. Assim, em 1620 foi reconhecida a inocência de Maria de Jesus e esta foi reeleita por unanimidade em 1624.
Os últimos dez anos de sua vida foram marcados pela enfermidade. Morreu aos oitenta anos, em 13 de setembro de 1640.
A cerimônia de beatificação aconteceu em 14 de novembro de 1976.